LabDAO está mapeando o futuro da IA ​​de código aberto para descoberta de medicamentos

O projeto Folding@home ganhou as manchetes durante a pandemia do COVID-19 por organizar o poder de computação não utilizado para explorar o espaço de pesquisa de dobramento de proteínas para combater o novo coronavírus. Capacitando os cidadãos a serem cientistas por direito próprio, a iniciativa executou simulações em larga escala de diferentes configurações moleculares de proteínas em uma rede distribuída de computadores “registrados” em todo o mundo.

Esse paradigma descentralizado foi anunciado por reunir as pessoas em torno de um problema comum e poder de computação de crowdsourcing de forma eficiente, mas e se o poder de computação e a infraestrutura de solução de problemas fossem invertidos? Em outras palavras, e se os indivíduos pudessem executar seus próprios projetos aproveitando o poder de computação acumulado e as ferramentas para a experimentação biológica para arrancar?

O LabDAO está tornando esse sonho realidade com sua plataforma PLEX. PLEX é uma ferramenta de linha de comando de código aberto projetada para tornar não apenas os recursos de computação, mas também uma variedade de ferramentas de aprendizado de máquina biológica (cunhado o conjunto “BioML” no LabDAO) acessíveis em uma variedade de origens. Seja experimentando o acoplamento de moléculas pequenas ou simulações de dobramento de proteínas próprias, o PLEX permite que os usuários acessem a biblioteca de ferramentas do LabDAO, compartilhem resultados e visualizem-nos em menos de cinco minutos.

Este conjunto de ferramentas e sua plataforma de habilitação de uso foram exibidos na cúpula Blockchain Meets Biology de Zuzalu no início de abril, onde Lily Hansen-Gillis, membro do LabDAO Core Team, demonstrou do início ao fim uma simulação da dinâmica molecular interna de um proteína para encontrar sua configuração mais estável. Então, como uma “não codificadora” autoproclamada, ela guiou o público do início ao fim - tudo com um computador, WiFi, PLEX na linha de comando e nada mais.

De forma mais ampla, o LabDAO é uma plataforma descentralizada habilitada para web3 (parte do movimento “DeSci” mais amplo) comprometida em criar um ambiente mais produtivo para a descoberta de medicamentos de código aberto. Ao disponibilizar ferramentas e recursos de ponta para um ecossistema mais amplo, o LabDAO visa criar o ambiente certo para avanços científicos transparentes e acessíveis. Seja eliminando a necessidade de os pesquisadores terem seu próprio hardware ou infraestrutura de computação ou publicando resultados de experimentos em um livro blockchain de forma que sejam tratáveis ​​e reprodutíveis, a organização está comprometida em tornar mais inovação possível por meio da colaboração - quebrando barreiras causadas por usabilidade e conhecimento de nicho isolado.

Os esforços do LabDAO para construir este mundo DeSci do futuro para hoje receberam recentemente um impulso na forma de uma rodada de financiamento de $ 3.6 milhões de vários outros DAOs, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan e outros. Este influxo de apoio contribuirá para os esforços contínuos para construir ferramentas de software de código aberto e reforçar o ecossistema de pesquisa do LabDAO.

Quanto ao próprio PLEX, os próximos passos imediatos no horizonte incluem testar a plataforma em diferentes colaborações científicas, contentorizar várias ferramentas e acumular o hardware necessário para promover a rede BioML.

Quanto ao longo prazo, talvez o próximo medicamento que salva vidas durante o próximo grande surto de doenças infecciosas seja projetado com o poder do PLEX, um passo descentralizado de cada vez. À medida que o ecossistema continua a crescer, só o tempo dirá.

Obrigado a Aishani Aatresh para pesquisas adicionais e relatórios sobre este artigo. Sou o fundador da SynBioBeta e algumas das empresas sobre as quais escrevo são patrocinadoras do Conferência SynBioBeta. Para mais conteúdo, você pode se inscrever em minha newsletter semanal.